O Custo de Oportunidade representa o valor ou beneficio que se perde ao escolher uma alternativa em detrimento de outra. No contexto de projetos de investimento e candidaturas a incentivos, este conceito e fundamental para justificar a necessidade do incentivo.
O Efeito de Incentivo — requisito obrigatorio em muitos sistemas PT2030 — esta diretamente relacionado com o custo de oportunidade. A empresa deve demonstrar que, sem o incentivo, o projeto nao seria realizado (ou seria realizado em menor escala, noutro local, ou com maior prazo), porque o custo de oportunidade de investir os recursos proprios noutras alternativas seria demasiado elevado.
Na pratica, a taxa de desconto utilizada no calculo do VAL (Valor Atualizado Liquido) reflete o custo de oportunidade do capital: se a TIR do projeto for inferior ao WACC (custo medio ponderado do capital), o projeto destroi valor para os acionistas.